生物の分類生物の分類（せいぶつのぶんるい）: この項目では生物を統一的に階級分類する方法を説明する。分類学、学名、、も参照のこと。 概説
判明している生物の種は、300万～1,000万種である。それぞれの種には学名（属名+種名）がつけられる。学名の前半は属名で、属とはごく類縁関係が近い種をまとめたものである。これらを分類してその分類グループに分類名をつけることが行われている。さらにこの分類を階層的に（小分類>中分類>大分類etc）体系付けすることで、いろいろな生物グループ同士の類縁関係、ひいては進化の系譜を明らかにしようとする。分類学は、それぞれの時代において、その当時までに判明した情報に基づいてできるだけ納得の出来るような分類の体系を模索し続けてきた。リンネの時代には形態を中心に、顕微鏡が使われるようになればそこから得られる情報をも利用し、生化学が発達すれば色素なども利用し、常にできるだけ納得のいく体系が探し求められた。そのため、分類体系は時代と共に変化しつつ、次第に正しい姿に近づいているものと考えられる。二〇世紀末には遺伝子そのものを参照する分子遺伝学の手法が取り入れられ、多くの分類群において大きな見直しが迫られている。したがって、このような体系は今後も変更を余儀なくされることがままあるはずである。しかしながら、それぞれの時点において、どれかの体系を採用しなければ文章は作れない。そのため、Wikipediaはそれぞれの群で特定の体系を採用している。したがって、その記述が他の書籍等と異なる場合があること、どちらが正しいかの議論が困難な場合があることを記しておく。 アリストテレスの分類
どのような分類体系が合理的かは、アリストテレス以来さまざまな工夫がされ、案が出されてきた。
彼の『動物の発生』では動物分類は次のようになる。
有血動物
## 胎生四足類
## 卵生四足類
## 無足類
# 不完全卵生
無血動物
# 不完全卵生
## 軟殻類
# 蛆生あるいは自然発生
## 有節類
# 無性生殖または自然発生
## 殻は類
## その他
アリストテレスの権威が絶対とされた中世は、この動物分類が支配的であった。 リンネの分類
近代的な分類法の刷新はリンネから始まった。
以下では現時点で生物分類でほぼ一般的に使われている分類体系フレームを記述する。
※ 分類体系はこれまでに述べたように、あくまでも人が扱いやすくするための人為的なものである側面があることに注意すること。
※ 近年では、さまざまな分野で伝統的な分類体系を 系統学の知見を反映させた体系に組替える動きが盛んである。 門は、動物界はPhylum、植物界、菌界はDivisionと使い分ける。
中間的分類が必要なときの階級名は、その分類単位よりも上位の分類には、大(Megn-)・上(super-)を、下位の分類には、亜(sub-)・下（infra-）・小(Parv-)などの接頭語を各階級の頭につけて生成させる。
Subfamily(亜科)とGenus(属)の間をさらに細分する必要があるときは、Tribe(族)を使う。
Subgenus(亜属)とSpecies(種)の間をさらに細分する必要があるときは、Section(節)を使う。 分類名の接尾辞
属より上位の分類名には、以下の表のとおり、規則的な接尾辞が付けられている。
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| 分類単位
| 植物
| 藻
| 菌
| 動物
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| 門
| Division/Phylum
| -phyta
| -phyta
| -mycota
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| 亜門
| Subdivision/Subphylum
| -phytina
| -phytina
| -mycotina
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| 綱
| Class
| -opsida
| -phyceae
| -mycetes
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| 亜綱
| Subclass
| -idae
| -phycidae
| -mycetidae
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| 目
| Order
| -ales
| -ales
| -ales
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| 亜目
| Suborder
| -ineae
| -ineae
| -ineae
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| 上科
| Superfamily
| -acea
| -acea
| -acea
| -oidea
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| 科
| Family
| -aceae
| -aceae
| -aceae
| -idae
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| 亜科
| Subfamily
| -oideae
| -oideae
| -oideae
| -inae
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| 族（連）
| Tribe
| -eae
| -eae
| -eae
| -ini
|
| 亜族（亜連）
| Subtribe
| -inae
| -inae
| -inae
| -ina
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上記の語尾は命名規約で指定されている物であるが、動物についてはある分類大系（鳥類のSibley分類体系）が自主的に下記のような独自の共通語尾を設定している。
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| 分類単位
| 鳥類
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| 上目
| Superorder
| -morphae
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| 目
| Order
| -iformes
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| 亜目
| Suborder
| -i
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| 下目
| infraorder
| -ides
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| 小目
| Parvorder
| -ida
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| 上科
| Superfamily
| (-oidea)
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| 科
| Family
| (-idae)
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| 亜科
| Subfamily
| (-inae)
|
| 族
| Tribe
| (-ini)
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| 亜連
| Subtribe
| (-ina)
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ただし、なにぶん限定された分類群に対して一部の分類大系が独自に行っていることでもあり、他の分野にはほとんど影響を与えていないようである。 界による分類
生物分類の階層構造の最上位は界(Kingdom)である。
この界は古代から伝統的に二界（植物界、動物界）に分けられてきたが、近代に微生物の知見が高まってくると、三界、五界、八界に分ける説などが登場してきた。 二界説
リンネが定めた分類法で生物を動物界(動いて餌を採るもの)、と植物界(動物ではないもの)の2界に分類したものである。 三界説
19世紀に入り、ヘッケル(Ernst Heackel)は動物とも植物ともとれる原始的な生物を3番目の生物界、原生生物界として分離し、動物界、植物界、原生生物界の三界とした。 五界説
五界説は、ホイタッカー(Robert H. Whittaker)の提唱した分類法で、現在の主流となっている。
細胞核を持たない原核生物をモネラ界として、カビ、キノコなどを菌界として新たに分離し、モネラ界、原生生物界、植物界、菌界、動物界の五界とした。
1980年代に入ると分岐分類学が優勢となり、動物界・植物界・菌界はそれぞれより狭義的な分類がふさわしいと考えられるようになる。1982年、マーグリスによって、それまで植物と考えられたすべての藻類、および菌類と考えられた粘菌類、卵菌類を原生生物界へと移す提案がなされた。これにより現在に至る五界説の骨格がほぼ決定した。 六界説
五界説のモネラ界をさらに細胞の特性で細菌界、古細菌界に分けたもの。1977年にカール・ウーズが提唱した。 八界説
五界説における原生生物というくくりは、植物、菌、動物ではない「その他」的なくくりであって、分類群としては非常に雑多であるという面がある。
これに手をつけたのが、キャバリエ＝スミスである。彼は、原生生物界をクロミスタ界、アーケゾア界、原生動物界に３分し、八界説を提唱した。それぞれ、クロミスタ界はワカメ等の褐藻植物を含む黄色植物やハプト藻類、クリプト藻類などの生物、アーケゾア界はミトコンドリアを持たない生物、原生動物界は動物的単細胞由来のもののうち胚分割しない生物、という分類になる。これによれば、生物は古細菌界、真正細菌界、アーケゾア界、原生動物界、クロミスタ界、植物界、菌界、動物界に分類される。
しかし、しばらくすると、ミトコンドリアを持たない生物はもともと持っていなかったものに加え、退化的にミトコンドリアを喪失したものもあることが指摘され、アーケゾア界というくくりに意義がなくなってきた。
最近では、さらに新しい界相当の分類方法として、アメーボゾア、リザリア、オピストコンタ、アーケプラスチダ、クロムアルベオラータ、エクスカバータ、といった真核生物の６分類方式が、国際原生動物学会より提出されている(2005年)。ウィキペディアの項目でも、これらを界として採用する場合が多くなっている。 三つのドメイン
近年、微生物の研究から界より上位に階層ドメイン（超界・域）を設定する仮説が提案されている。これは、DNAデータの分子系統解析によって、（動物界、植物界、原生生物界などが含まれる）真核生物、（真性）細菌、古細菌として分ける説である。この分類は、各グループのの細胞の構成や化学組成の違いとも合致する。 各界の関連
一般的分類例
門
門
門
門
門
門
門
門
門
門
門
門
門
門
門
門
門
門
門
その他
地衣植物門（菌類と藻類の共生体・学名は菌類のもの）
分子系統学的分類例
20世紀後半から勃興した、タンパク質のアミノ酸配列や核酸の塩基配列決定法の技術、そしてそのデータを用いて系統の類縁関係を推定する解析手法の進展に伴って、従来の生物系統分類法は大きな変革を迫られている。特に、これまで他のグループに所属させることができないために一括りに分類されていた、原生生物や藻類、一部の菌類につき系統が大幅に見直されつつある。学問上は二界説ないし五界説は既に瓦解したと言っても過言ではない。ここではキャヴァリエ＝スミス(Thomas Cavalier-Smith)らが中心となって提唱している分子系統学的分類の一例を示す（ただし現生生物のみ）。従来の界、門、綱との整合性は今後の課題である。この分野は現在さらに進展しつつあるため、今後も大小の変更があり得る。 原核生物
核膜無し、環状染色体、細胞骨格・原形質流動無し、70Sリボソーム、有糸分裂無し
古細菌(Archaebacteria,Archaea) シュードムレインまたはS-レイヤー細胞壁、 エーテル型脂質、イントロン有り 真核生物
核膜有り、線状染色体、細胞骨格・原形質流動有り、80Sリボソーム、有糸分裂有り
バイコンタ(Bikonta) 2本 鞭毛を持つ真核生物（退化により持たないものも有り） エクスカヴェート(Excavates) 細胞腹側に深くえぐれた捕食装置を有する真核生物の一群
マラウイモナス(Malawimonas) 盤状クリステ類の可能性あり
トリコゾア類(Trichozoa) ：ディプロモナス類、レトルタモナス類、パラバサリア類
アネロモナス類(Anaeromonada) ：オキシモナス類
無殻太陽虫類(Actinophryida)
ビコソエカ（ビコエカ）類(Bicosoecales、Bicoecales)
プラシディア類(Placididea)
デヴェロパエラ(Developayella)
アルベオラータ(Alveolata) 細胞膜直下に扁平な小胞を有する真核生物の一群
リザリア(Rhizaria) 分子情報による類縁、アメーバ状生物が多いが全てに共通する形態的特性は無い
所属不明
クリプト植物(Cryptophyta) 独立の界とする研究例有り
ハプト植物(Haptophyta) 植物に近縁とする研究例有り
アプソゾア類(Apusozoa)
有中心粒類(Centrohelida) バイコンタとアメーボゾアの間に位置するという研究例有り
ユニコンタ(Unikonta) 1本鞭毛を持つ真核生物（真菌類は 退化して鞭毛を持たない）
アメーボゾア(Amoebozoa) 分子情報による類縁、真核生物の最も原始的な系統、アメーバ状生物が多い（アメーボゾアとバイコンタを統合してアンテロコンタ(Anterokonta)とする説有り）
葉状仮足類（ロボサ）(Lobosa) ：アメーバ類
オピストコンタ(Opisthokonta) 鞭毛を後方にして運動する真核生物
メソミセトゾア(Mesomycetozoa) ：イクチオスポラ類
後生動物(Metazoa) 例：海綿動物、刺胞動物、脱皮動物（線形動物、節足動物）、冠輪動物（扁形動物、環形動物、軟体動物）、後口（新口）動物（棘皮動物、半索動物、脊索動物） 参考文献
関連項目
- 分類表の体裁などはこちらを参考して下さい。
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